随着粮食产量的提高，土壤元素缺乏的现象已经表现出来，现在农民开始更多地选用多元复合肥，复合肥料特别是高浓度复合肥料是化肥品种发展的必然趋势。多数国家的早期化肥工业以单元肥料为主。但随着土壤肥料科学和农业施肥技术的发展，农业已走向科学施肥。科学施肥须根据不同的土壤类型和性质、肥效水平以及作物种类和气候条件等因素决定施肥品种和数量，这样就可以避免土壤中过量施用或短缺营养元素，而复合肥具有养分含量高、副成分少且物理性状好等优点，对于平衡施肥，提高肥料利用率，促进作物的高产稳产有着十分重要的作用。
综合来看复合肥的优点包含如下：1.养分含量高，主要营养元素多。复合肥的状分总量一般比较高，营养元素种类较多，一次施用复合肥，至少同时可供应作物两种以上的主要营养元素。2.副成分少，结构均匀。例如磷酸铵不含任何无用的副成分，其阴、阳离子均为作物吸收的主要营养元素。这种肥料养分分布比较均一，在造成颗粒后与粉状或结晶状的单元肥料相比，结构紧密，养分释放均匀，肥效稳而长。由于副成分少，对土壤不利影响小。3.物理性状好。复合肥一般多制成颗粒，吸湿性小，不易结块，便于贮存和施用，特别便于机械化施肥。4.节省贮运费用和包装材料。由于复合肥中副成分少，有效成分含量一般比单元肥料高，所以能节省包装及贮存运输费用。例如，每贮运1吨磷酸铵，约等于贮运过磷酸钙及硫酸铵共4吨。
复合肥的缺点主要是：1.养分的比例固定，难以满足各类土壤和各种作物的需要。2.各种养分在土壤中运动速率各不相同，被保持和流失的程度不同，因而在施用时间、施肥位置等很难满足施肥技术上的要求。
复合肥肥效长，宜做基肥。大量试验表明，不论是二元还是三元复合均以基施为好。这是因为复合肥中含有氮、磷、钾等多种养分，作物前期尤其对磷、钾极为敏感，要求磷、钾肥要作基肥早施。控释复合肥在生产过程中采用了包衣、造粒等工艺，肥效缓慢平稳，比单质化肥分解慢，养分淋失少，利用率高，适合于作基肥。一般亩用量为30至40千克。复合肥不宜用于苗期肥和中后期肥，以防贪青徒长。复合肥分解较慢，对播种时用复合肥做底肥的作物，应根据不同作物地需肥规律在追肥时及时补充速效氮肥，以满足作物营养需要。
复合肥浓度差异较大，应注意选择合适的浓度。目前多数复合肥是按照某一区域土壤类型平均养分善和大宗农作物需肥比例配置而成。市场上有高、中、低浓度系列复合肥，一般低浓度总养分在25%至30%之间，中浓度在30%至40%之间，高浓度在40%以上。要因地域、土壤、作物不同，选择使用经济、高效的复合肥。一般高浓度复合肥用在经济作物上，品质优、残渣少、利用率高。
复合肥浓度较高，要避免种子与肥料直接接触，会影响出苗甚至烧苗、烂根。播种时，种子要与穴施、条施复合肥相距5到10厘米左右，切忌直接与种子同穴施，造成肥害。复合肥配比原料不同，应注意养分成分的使用范围。不同品牌、不同浓度复合肥所使用原料不同，生产上要根据土壤类型和作物种类选择使用。含硝酸根的复合肥，不要在叶菜类和水田里使用含铵离子的复合肥，不宜在盐碱地上施用；含氯化钾或氯离子的复合肥不要在忌氯作物或盐碱地上使用；含硫酸钾的复合肥，不宜在水田和酸性土壤中施用。否则，将降低肥效，甚至毒害作物。复合肥中含有两种或两种以上大量元素，氨表施易挥发损失或雨水流失，磷、钾易被土壤固定，特别是磷在土壤中移动性小，施于地表不易被作物根系吸收利用，也不利于根系深扎，遇干旱情况肥料无法溶解，肥效更差。所以复合肥的施用应尽可能避免地表撒施，应深施覆土。正确使用复合肥，会给我们带来良好的收益。另外在选择复合肥时也要注意所含的养分情况以及包装和生产厂家，谨防受骗。
植物需要的元素不只是氮，磷，钾，还需钙，镁等多种元素，复合肥实际上是指含有两种或两种以上植物所需元素的肥料。如羟基磷酸钙，硝酸铵等。对植物施用复合肥应该注意植物的生长期，种类，并施用含有植物所需元素的复合肥，利于植物生长。若复合肥施用过量，会造成植物体内某种元素富集，影响植物生长，还可能使土壤下液体浓度过高，造成烧苗现象。
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